Selon Alphonse Mustel, c'est Lefébure-Wély, qui, le premier, utilisa la registration avec les carrés pour l'harmonium d'art. Donc en 1869 au plus tard. Cette notation s'est imposée petit à petit... ou pas! Edouard Mignan, au XXe siècle, utilise encore les cercles, par exemple. Guilmant utilise tantôt l'une, tantôt l'autre. La double notation est très utile quand les compositeurs registrent pour deux types d'instruments (voyez Leybach, par ex.) Quant à Karg-Elert, il note parfois une triple registration! des ronds, des carrés ou des octogones...
Cela dit, je n'ai pas encore trouvé de partitions de Lefébure-Wély avec notation carrée, bien que je connaisse plusieurs de ses compositions pour harmonium d'art. Il y a, par exemple, une œuvre tardive dont je n'ai pas trouvé d'édition qui s'appelle: "Souvent femme varie"... Tout un programme! (contemporaine des "Caquets du couvent"...........)